(一)要求土壤墑情適宜。土壤太干或太濕都不利于菌肥肥效的發(fā)揮，適宜的土壤濕度為60%左右，即見干見濕土壤濕度最為適宜。
　　(二)不能與殺菌劑混用�；钚跃�是菌肥的主要體現(xiàn)，與殺菌劑混用，殺菌劑殺滅了菌肥中的活性菌，降低菌肥的肥效。
　　(三)不能與化肥混用。化肥多數(shù)為無機鹽類的化學(xué)物質(zhì)和有機化合物中易分解而產(chǎn)生無機鹽類的肥料。高濃度的化學(xué)物質(zhì)對菌肥里的微生物有毒害作用，進而影響微生物的存活。尤其值得注意的是：不能與碳酸氫銨等生理堿性肥料和硝酸銨等生理酸性肥料混用。
　　(四)不同種類的菌肥也不宜混用。市場上的菌肥種類很多，其所含的活性菌種類、作用不同，它們之間是否有相互抑制作用還不是很清楚，若相互抑制，則會降低肥效。